食物監測計劃是為了控制及預防食物危害而設，亦是本中心保障食物安全的一個主要環節。計劃旨在顯示食物是否可供安全食用。
透過食物監測計劃，本中心人員會在入口、批發和零售三個層面抽取食物樣本，作微生物、化學及輻射測試，以評估食物的風險。微生物測試包括檢測細菌及病毒，而化學測試則包括化驗食物添加劑、污染物及其它有害殘留物及毒素。為提高市民對不同食物風險的認識，本署會定期公布監測計劃的測試結果，讓公眾參考。
提升食物監測計劃的成效有賴食物風險評估為計劃制訂的基礎，並需配以廣泛的涵蓋範圍。公共衞生化驗中心已於2001年年尾落成，其內設有一所嶄新的食物研究化驗室。該化驗室所進行的研究工作，將大大幫助風險評估及制訂食物監測策略。
因應世界各地現時較多進行專項食品調查的國際趨勢，中心自2007年開始採取以專項食品和以民為本的方法，推行三個層面的食品監測策略，包括日常食品監測、專項食品調查及時令食品調查。
食物監測計劃結果:
有關最新食物安全報告和食物調查結果，以及主要食物事故和食物進口及銷售禁令，請參閱相關新聞公報。
